Действие игры начинается с 1 сентября 1864 г. То есть после событий Икеда-я и "Дела о дворцовых воротах".

Шинсен
После уже упомянутых событий, Шинсен прославился, и перестал испытывать нужду в деньгах и новобранцах.
Два месяца назад в Шинсен вступил новичек - юноша из хорошей семьи, который был определен в первый отряд. Его владение мечом было вполне на уровне, но недоставало опыта сражений.
Не смотря на это, он быстро и близко подружился с Окитой - Катсуми был всего на год младше, и характерами они были весьма схожи.

Первое утро сентября выдалось довольно душным. Не смотря на это, патрулирующий Первый отряд, следуя примеру своего командира, пребывал в отличном расположении духа.
Внезапно, на одной из узких улочек путь им преградила кучка горожан, споривших с охранниками, сопровождающими вычурно украшенный паланкин. Приказ был прост - разогнать толпу и освободить проход.
Отряд двинулся дальше, тут же забыв об этом столкновении. Чего не скажешь о человеке, сидевшем в том паланкине, и пристальным взглядом провожавшем молодого воина, который ничего не подозревая весело болтал с командиром отряда..

Уномаса Удо
Человек, сидящий в паланкине, приподнял полог и выглянул наружу. Будучи невероятно раздраженным этой незапланированной остановкой, он собирался уже было вылезти и разобраться лично, как взгляд его упал на нечто необыкновенное. Прищуренные серые глазки мгновенно вспыхнули похотливым огоньком. Среди солдат в бело-голубых форменных хаори он увидел красивого стройного юношу лет 20-ти.

А человек этот был не кто иной, как Уномаса Удо. Торговец лет 50-ти, довольно низкого происхождения, но благодаря своему богатству, имевший связи среди высокопоставленных знатных особ, вне зависимости от их политических убеждений. Откуда взялось его состояние, толком никто не знал, однако всего года за два он из мелкого торговца специями превратился в богача. Вот уже лет шесть как Уномаса слыл уважаемым, законопослушным, а главное, щедрым господином. Поговаривали, что ему помогли боги, поскольку он был весьма верующим человеком.
И лишь очень немногие посвященные знали истинную причину успеха его бизнеса - торговля опиумом, а также.. "живым товаром". Как следует "воспитанные", красивые японские мальчики стоили дорого, тем более, за границей.
Но не весь товар шел за рубеж. Наиболее ценные экземпляры Уномаса оставлял для собственного удовольствия, а также в качестве презентов для своих покровителей.
В последнее время Уномаса как раз думал о том, что нынешний любимчик ему порядком надоел, и пора бы подыскать замену. Да только кандидатуры на его взыскательный вкус не было. До сих пор..
Связываться с Шинсенгуми.. сложно, опасно, рискованно. Но похоть и жажда наживы взяли верх.
Чтобы заманить свою жертву в ловушку, Уномаса был готов задействовать все имеющиеся связи.

последователи Миккё
После пожара во дворце Маро, Кичисабуро исчез. Никто и никогда больше не видел его.
Но Фурубе и его единомышленники не оставили идею заменить настоящего Окиту своим "клоном", послушным и легко контролируемым. Они затаились во тьме, ожидая своего часа.
Используя силу Миккё, они проводят эксперименты по созданию двойника Окиты, неотличимого от оригинала. Причем не только внешне.. Однако все опыты один за другим проваливаются. Фурубе понимает, что для удачного завершения эксперимента необходим "живой образец" - волос, капелька крови.. Достать таковой не так то просто.
Фурубе начинает поиски союзника, даже не сомневаясь, что среди влиятельных противников сегуната найдется желающий помочь ему добыть такой образец.. Ведь сейчас, когда Шинсенгуми на пике славы, его исследования были актуальны как никогда.

Тёсю
Вынашивают (и пытаются осуществить) гнусные планы мести Волкам Мибу, за все хорошее что было между ними.